Lupina, především lupina mnoholistá, je v české přírodě považována za nevhodnou a invazivní rostlinu z několika důvodů:

• Vytlačuje původní druhy rostlin
  Lupina roste velmi rychle, vytváří husté porosty a zabírá prostor původním lučním a horským rostlinám, které pak nemají dostatek světla ani živin.
• Mění složení půdy
  Jako bobovitá rostlina váže dusík ze vzduchu a obohacuje jím půdu. To sice prospívá lupině, ale škodí druhům, které jsou přizpůsobené chudým půdám. Kvůli tomu mizí vzácné rostliny typické pro české louky.
• Snižuje biodiverzitu
  Na místech zarostlých lupinou bývá méně různých druhů rostlin i hmyzu. Krajina se stává druhově chudší.
• Snadno se šíří
  Lupina produkuje velké množství semen, která se rychle rozšiřují podél cest, řek nebo na neudržovaných loukách.
• Ohrožuje chráněná území
  V některých chráněných krajinných oblastech a na horských loukách představuje problém, protože narušuje přirozené ekosystémy.

Proto se v České republice doporučuje lupinu v přírodě nešířit, pravidelně ji sekat nebo odstraňovat před dozráním semen.